การจำแนกชนิดโดยใช้ลำดับเบสของยีน Small subunit ribosomal RNA (SSUrRNA) และการเพิ่มจำนวนยีน Rhoptry associated protein-1 (rap-1) ของเชื้อมาลาเรียไก่ที่ระบาดในประเทศไทย ด้วยเทคนิคโพลิเมอเรสเชนรีแอคชัน

Abstract

จำแนกชนิดของเชื้อมาลาเรียไก่ 3 ไอโซเลท ที่พบในพื้นที่รอบนอกของกรุงเทพมหานครและจังหวัดข้างเคียง โดยการเพิ่มจำนวนดีเอ็นเอส่วนของยีนที่มีรหัสในการสร้าง small subunit ribosomal RNA(SSUrRNA) ช่วงลำดับเบสที่ 1,422 ถึง 1,702 ด้วยปฏิกิริยา polymerase chain reaction และเปรียบเทียบกับลำดับเบสที่ได้กับยีนที่มีรหัสในการสร้าง SSUrRNA ของเชื้อมาลาเรียที่พบในสัตว์ปีก 3 ชนิดอื่นในฐานข้อมูล GeneBank คือ Plasmodium gallinaceum, P.lophurae และ P.relictum จากการเปรียบเทียบลำดับเบสด้วยโปรแกรม DNASIS พบว่าลำดับเบสที่ได้มีความเหมือนกันกับยีน SSUrRNA ของเชื้อมาเลเรียชนิด P.gallinaceum ถึง 100% และมีความเหมือนกันกับยีน SSUrRNA เชื้อมาลาเรียชนิด P.lophurae และ P.relictum ที่ 56.2% และ 58.0% ตามลำดับ จากผลการทดลองนี้เป็นการยืนยันว่าเชื้อมาเลเรียในไก่ทั้ง 3 ไอโซเลทที่ระบาดในพื้นที่รอบนอกของกรุงเทพมหานคร และจังหวัดข้างเคียงเป็นเชื้อมาลาเรียชนิด P.gallinaceumเมื่อขยายจำนวนดีเอ็นเอจากยีน rhoptry associated protein-1 (rap-1) ของเชื้อ P.gallinaceum โดยใช้ primers ที่มีความจำเพาะต่อเชื้อมาลาเรียในคนชนิด P.falciparum ซึ่งมีความใกล้เคียงกันทางพันธุกรรม หลังการตรวจสอบผลิตภัณฑ์ของปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอร์เรส ไม่ปรากฏแถบดีเอ็นเอของยีน rap-1 จากเชื้อ P.gallinaceum ในขณะที่เชื้อ P.falciparum มีแถบดีเอ็นเอปรากฏชัดเจน จากการทดลองดังกล่าวพบว่า primers ที่มีความจำเพาะต่อยีน rap-1 ของเชื้อ P.falciparum ไม่สามารถขยายจำนวนดีเอ็นเอจากยีน rap-1 ของเชื้อ P.gallinaceum ได้ ซึ่งอาจเป็นเพราะยีน rap-1 มีความแตกต่างจาก P.falciparum หรือไม่มียีนดังกล่าวอยู่ใน P.gallinaceum